Учет в интернет магазине врядли будет отличаться от учета в обычном. Мы продаем товар, либо услугу. А где их продавать в реальном магазине или в интернет, разницы мало. В интернете есть свои особенности с заказом, и доставкой.
Программу я бы порекомендовал 1с - бухгалтерию 7.7, хоть там и нужно небольшое знание счетов, но она проще чем 1С торговля.
